南區國稅局表示，總機構在國外的外商營利事業，在我國的繳稅方式有三種：

(一)辦理結算申報納稅　　外商在我國境內設有固定營業場所或營業代理人者，應由其固定營業場所或營業代理人辦理結算申報納稅，和我國一般營利事業的繳稅方式相同，是以收入減除成本費用後的所得，按25%稅率計算應納稅額。

(二)由給付人扣繳納稅　　外商在我國境內無固定營業場所及營業代理人者，由給付外商所得的給付人，以所給付金額按規定的扣繳率扣繳納稅，目前的扣繳率，除股利所得是25%外，其他各類所得均為20%。 　　

(三)依所得稅法第25條規定按外商取得收入之10%或15%計算所得額後，由其在我國境內固定營業場所併同辦理結算申報納稅，或由其營業代理人或所得給付人按25%扣繳納稅。

　　以上述第(二)種及第(三)種繳稅方式來比較外商的實質稅負，第(二)種是收入金額的20%，第(三)種則是收入金額的10%或15%，再乘以25%，等於是收入金額的2.5%(10%*25%)或3.75%(15%*25%)。因此，外商這兩種繳稅方式的實質稅負差異相當大，差額高達5倍至8倍。

　　該局進一步指出，雖然上述第(三)種方式，不論外商在我國境內有無固定營業場所或營業代理人均可適用，而且對減輕外商的稅負確有極大的效果，但要適用第(三)種方式繳稅，必須同時符合所得稅法第25條規定的3項條件：
(1)外商在我國境內必須是經營國際運輸、承包營建工程、提供技術服務或出租機器設備等4項業務。
(2)外商在我國境內經營上述4項業務取得的收入，其成本費用分攤計算困難。
(3)必須向財政部申請並獲得核准適用。

　　外商如同時符合上述3項條件者，其在我國境內取得的國際運輸收入可按10%，其餘3項業務收入可按15%計算所得額後，再辦理結算申報或依扣繳率25%扣繳納稅。

　　國稅局最後表示，外商適用所得稅法第25條規定的申請案件，受理單位原來是財政部，不過，這項業務自96年4月1日起，改由各地區國稅局就近辦理，因此，南區國稅局轄區的外商如有符合所得稅法第25條規定的3項條件者，可直接向該局提出適用申請，將可節省不少稅負！