財政部臺北市國稅局表示，分公司本身不具有獨立人格，不能為權利義務主體，故分公司註銷營業登記，無須依所得稅法第92條第1項但書規定，於10日內向稽徵機關辦理扣繳憑單申報。

該局說明，依所得稅法第92條規定，扣繳義務人應於每年1月底前將上一年內扣繳各納稅義務人之稅款數額，開具扣繳憑單，彙報稽徵機關查核；並應於2月10日前將扣繳憑單填發納稅義務人。但營利事業有解散、廢止、合併或轉讓，或機關、團體裁撤、變更時，扣繳義務人應隨時就已扣繳稅款數額，填發扣繳憑單，並於10日內向該管稽徵機關辦理申報。分公司申請營利事業歇業（註銷）登記經核准，尚非前揭法令所稱之解散、合併、廢止或轉讓，自無所得稅法第92條第1項但書規定之適用。

該局呼籲，分公司於年度中辦理營利事業歇業（註銷）登記經核准者，其已扣繳之稅款應由總公司於次年1月底前彙總申報稽徵機關，其涉有短漏報情事者，仍應依同法相關規定處罰。